细胞与分子免疫学杂志

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系统性硬化症线粒体功能相关的差异表达基因的生物信息学分析

作者:

巴燕娜1, 苏丽萍2, 刘曼玲2, 袁晴2, 吴振彪1, 袁志栋3*(空军军医大学: 1西京医院临床免疫科, 2基础医学院生理与病理生理学教研室, 3生物医学工程学系, 陕西 西安 710032)

出版年,卷期:

2019 第(35)卷 第(8)期 起止页码 707-713 页

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摘要:

目的 通过分析线粒体功能相关基因在系统性硬化症(SSc)患者皮肤活检组织中的表达情况来研究线粒体和SSc之间的关系。方法 使用基因表达汇编(GEO)数据库中SSc皮肤活检组织基因芯片表达谱数据, 采用t检验和倍数变化(FC)的差异基因分析方法筛选出线粒体功能相关的差异表达基因(DEG), 并对其进行功能注释、 功能富集和蛋白质相互作用网络分析。结果 在SSc组织中共识别出422个显著差异的DEG, 其中23个DEG是线粒体功能相关基因。对这23个基因进行功能注释和富集分析, 发现异常表达的线粒体功能相关基因主要影响线粒体能量供应、 细胞代谢等生物学过程。结论 SSc的发生发展伴随着线粒体功能相关基因的异常表达, 提示线粒体功能异常与SSc发病相关。